RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259008.6

BRIP1-201, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIP1, Length 6,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-201ENST00000259008 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ASAH2Q9NR71 780 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 IMPG1Q17R60 797 aa6.68□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.68□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.68□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 OOSP2Q86WS3 158 aa6.68□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.68□□□□□ -1.34
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