RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259006.7

LIMD2-201, Transcript of LIM domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD2, Length 3,193 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2-201ENST00000259006 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 A0A0G2JND7 137 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MXI1P50539 228 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MTFR1Q15390 333 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MFSD5Q6N075 450 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 LMO3Q8TAP4 145 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CFAP69A5D8W1 941 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CYP3A4P08684 503 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 GSTT2P0CG29 244 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 GSTT2BP0CG30 244 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ARP10275 920 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ANXA13P27216 316 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ATP5DP30049 168 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CPA2P48052 419 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SEMA4DQ92854 862 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CATSPER2Q96P56 530 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CROTQ9UKG9 612 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PCNTO95613 3336 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 GAS8O95995 478 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 HSPA6P17066 643 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FMO1Q01740 532 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PLCB3Q01970 1234 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 LIN52Q52LA3 116 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MAGEB18Q96M61 343 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CENPKQ9BS16 269 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MYH11P35749 1972 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SLC16A4O15374 487 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ATP9BO43861 1147 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 WFS1O76024 890 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ALAS1P13196 640 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 GAP43P17677 238 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CROCCP2Q86T23 111 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 LXNQ9BS40 222 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CCDC160A6NGH7 325 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 VAV1P15498 845 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CHRNA5P30532 468 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 VHLP40337 213 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CD97P48960 835 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SLC1A5Q15758 541 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SPATA17Q96L03 361 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FIZ1Q96SL8 496 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TRABDQ9H4I3 376 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 KAT6AQ92794 2004 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 RREB1Q92766 1687 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PLSCR1O15162 318 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CDH16O75309 829 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PLS3P13797 630 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 PIK3CAP42336 1068 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 HAPLN3Q96S86 360 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 CCDC77Q9BR77 488 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMD2-201ENST00000259006 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms