RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A7Q96T83 725 aa28.04■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 GJB5O95377 273 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 AMHP03971 560 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 GATMP50440 423 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 JAM2P57087 298 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 FZD8Q9H461 694 aa28.04■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF131P52739 623 aa28.03■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRADDQ15628 312 aa28.03■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 MYCT1Q8N699 235 aa28.03■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 HES6Q96HZ4 224 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 TIPINQ9BVW5 301 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ODF2LQ9ULJ1 636 aa28.03■■■□□ 2.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.99■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 NCKAP1LP55160 1127 aa27.98■■■□□ 2.07
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