RNA–Protein interactions for RNA: YPR003C

YPR003C, Transcript of Putative sulfate permease, yeastyeast

Gene YPR003C, Length 2,265 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR003CYPR003C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YER190C-BP0CX94 160 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YEL077W-AP0CX95 160 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YGR296C-BP0CX96 160 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YPL283W-BP0CX97 160 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YPR204C-AP0CX98 160 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C TFS1P14306 219 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C FUB1P25659 250 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C RPS20P38701 121 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C SMD3P43321 101 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C VPS25P47142 202 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C HSK3P69852 69 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YLR042CQ07990 161 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YDR215CQ12240 137 aa3.36□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C HIP1P06775 603 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YML003WP0CF16 290 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C CDC26P14724 124 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C UTR5P32630 166 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C SOR1P35497 357 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C PAU24P38155 120 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YIL059CP40520 121 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C BNA2P47125 453 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YDL186WP48568 277 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C KEI1Q06346 221 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C TDA6Q06466 467 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C RXT3Q07458 294 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C SOR2Q07786 357 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YLR118CQ12354 227 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C SWM1Q12379 170 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C SEC4P07560 215 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YSR3P23501 404 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C NNK1P36003 928 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YHR177WP38867 453 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C PRE5P40302 234 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C BUD25P85052 153 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C ELP6Q04868 273 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YML053CQ04978 212 aa3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C COX1P00401 534 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C GLN3P18494 730 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YPS1P32329 569 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YKL107WP34251 309 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YEL073CP39974 107 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YIL012WP40551 113 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YGR149WP48236 432 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C INP1Q03694 420 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YMR074CQ04773 145 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YOR376WQ08900 122 aa3.34□□□□□ -1.87
YPR003CYPR003C YCR100CP25606 316 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C ATS1P31386 333 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C CLB6P32943 380 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C CSE2P33308 149 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
YPR003CYPR003C MRPS5P33759 307 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C EMC3P36039 253 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C SHB17P36136 271 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C YBR090CP38253 122 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C SWM2P40342 146 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C DLS1P40366 167 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C TOS2P50078 622 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C DUG3P53871 357 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C TRI1Q05024 226 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C GRX8Q05926 109 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PIN3Q06449 215 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C YOL073CQ08232 322 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C CHO1P08456 276 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PHO85P17157 305 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C YMC1P32331 307 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C MRPS9P38120 278 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PRM5P40476 318 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C YPS6P40583 537 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C CWP2P43497 92 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C SNO3P43544 222 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PRY1P47032 299 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C EAF6P47128 113 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C GLO1P50107 326 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C VHT1P53241 593 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C SNO2P53823 222 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PAU23Q07987 124 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C PAU17Q12370 124 aa3.33□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C MTC7P32633 139 aa3.32□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C TEM1P38987 245 aa3.32□□□□□ -1.88
YPR003CYPR003C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
YPR003CYPR003C LCB3P47013 409 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 181 ms