RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	MAK31	P23059	88 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YCR101C	P25607	182 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YIL012W	P40551	113 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	RPA43	P46669	326 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YML108W	Q03759	105 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	EMI1	Q04406	187 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	LDB18	Q07887	179 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	TIM22	Q12328	207 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YER186C	P40101	306 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	MEP2	P41948	499 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	AKR2	Q12013	749 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	DAS2	Q12084	232 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TYW1	YPL207W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	STP22	P25604	385 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	ERG2	P32352	222 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	MED6	P38782	295 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	STB1	P42845	420 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	MDM34	P53083	459 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	THI74	Q04083	370 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	ATP14	Q12349	124 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TRS20	P38334	175 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YER189W	P40104	122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RFC2	P40348	353 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	PGD1	P40356	397 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	SDH7	Q04401	133 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	FMP42	Q04991	504 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YPS3	Q12303	508 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	MRP49	P32388	137 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	PHO89	P38361	574 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YHI9	P38765	294 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YIL152W	P40455	235 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YGL088W	P53151	121 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	CAB4	P53332	305 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	HHT1	P61830	136 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	LPP1	Q04396	274 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	ATG5	Q12380	294 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	CCH1	P50077	2039 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	NMT1	P14743	455 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	SEC17	P32602	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TKL2	P33315	681 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YPL073C	P40323	161 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YFL067W	P43537	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	JID1	Q12350	301 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	Q0255	P03881	472 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TFC1	P32367	649 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	AVT6	P40074	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	DLS1	P40366	167 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	GAS3	Q03655	524 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YND1	P40009	630 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YFR054C	P43622	192 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YJL028W	P47062	111 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	BIR1	P47134	954 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TTI2	P47168	421 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YGL262W	P53054	175 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	IZH2	Q12442	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	VMA7	P39111	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	TIM17	P39515	158 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	SLM2	P53955	656 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	MSA2	P36157	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	POP4	P38336	279 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	OST2	P46964	130 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	INP1	Q03694	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TYW1	YPL207W	CNL1	Q06333	122 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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