RNA–Protein interactions for RNA: YOR250C

CLP1, Transcript of Component of the cleavage and polyadenylation factor I (CF I), yeast

Gene CLP1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLP1	YOR250C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	TIR1	P10863	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	CPR2	P23285	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	LSB5	P25369	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	PAU3	P25610	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	PRY2	P36110	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	EHT1	P38295	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YEA4	P40004	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	PHS1	P40857	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	MOB2	P43563	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	BNS1	P50084	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	VEL1	P53058	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YIP4	P53093	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	CAB5	Q03941	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	CCH1	P50077	2039 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLP1	YOR250C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YLR152C	P54072	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	AIM34	Q03673	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	TRS23	Q03784	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	PAM18	Q07914	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	GRE1	Q08969	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	VPS68	Q12016	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	GEP5	Q12393	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MDM35	O60200	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	GPX1	P36014	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	PHD1	P36093	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YBR292C	P38357	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	SHO1	P40073	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	OST3	P48439	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YLR460C	P54007	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ABF2	Q02486	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RCE1	Q03530	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MRX8	Q05473	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MCT1	Q12283	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ATG5	Q12380	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	IZH2	Q12442	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	VPS63	O13549	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	COX2	P00410	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RAD6	P06104	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	CYC3	P06182	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MTC7	P32633	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	SLM6	P38343	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	CUE1	P38428	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	DOG1	P38774	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ANS1	P38832	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YNL092W	P53934	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RSM23	Q01163	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	INP1	Q03694	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MSW1	P04803	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RIP1	P08067	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	STP22	P25604	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	UMP1	P38293	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	UME6	P39001	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	IRC22	P40006	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	PAU5	P43575	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	LST7	P53237	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	SUR7	P54003	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	THI74	Q04083	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	SEI1	Q06058	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	RRG8	Q06109	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	PIN3	Q06449	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	FRE8	Q12209	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	PAI3	P01094	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	CTA1	P15202	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MAK32	P23060	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	MRP49	P32388	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CLP1	YOR250C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLP1	YOR250C	ERG28	P40030	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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