RNA–Protein interactions for RNA: YLL009C

COX17, Transcript of Copper metallochaperone that transfers copper to Sco1p and Cox11p, yeast

Gene COX17, Length 210 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX17	YLL009C	CSH1	P38287	376 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	MBA1	P38300	278 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	YJL213W	P40896	331 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	SNO3	P43544	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	FIP1	P45976	327 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	YNL234W	P53857	426 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	MCP1	Q12106	302 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
COX17	YLL009C	RAD10	P06838	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ATP5	P09457	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GPX1	P36014	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPB11	P38902	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GGC1	P38988	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YER181C	P40097	107 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	AVT7	P40501	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SNM1	P40993	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	DOC1	P53068	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SCW10	Q04951	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SML1	Q04964	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	HIR3	P47171	1648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	PDR11	P40550	1411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	COQ2	P32378	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YGL193C	P53097	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GAS3	Q03655	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	IZH2	Q12442	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	LAS17	Q12446	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	PEP1	P32319	1579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	OMA1	P36163	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YMC2	P38087	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	MIT1	P40002	666 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YNR014W	P53719	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	BUD25	P85052	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RAD6	P06104	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	IMP1	P28627	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SCM4	P32564	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SMP1	P38128	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ERV15	P38312	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	TRS20	P38334	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YHR130C	P38834	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	FMP48	P53233	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YGR164W	P53291	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	UIP4	Q08926	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	CAT8	P39113	1433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SGA1	P08019	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	MRS3	P10566	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	MRPL44	P19956	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	AHT1	P29589	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	LDS1	P31379	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	CSE2	P33308	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SDH4	P37298	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	NSG1	P38837	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	VPS25	P47142	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	EMC4	P53073	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	BPT1	P14772	1559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	LDB16	P25587	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SFT2	P38166	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	GAA1	P39012	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SPC25	P40014	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ERV14	P53173	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	FSH2	Q05015	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	KEI1	Q06346	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	CYC7	P00045	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	PHO89	P38361	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SDS23	P53172	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	LPP1	Q04396	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX17	YLL009C	ATG10	Q07879	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.2 ms