RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	MAK32	P23060	363 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SPO13	P23624	291 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YCR025C	P25352	136 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SIP1	P32578	815 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YOX1	P34161	385 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	5.5	□□□□□ -1.53	not detected
MIA40	YKL195W	YBR220C	P38318	560 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SEN34	P39707	275 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	GTT1	P40582	234 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RTS2	P40962	232 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	GON7	P46984	123 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	TTI2	P47168	421 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	CRZ1	P53968	678 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	LPP1	Q04396	274 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YMR253C	Q04835	414 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	FSH2	Q05015	223 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	DCS1	Q06151	350 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPS23B	P0CX30	145 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ROX3	P25046	220 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	REC104	P33323	182 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	MRPL4	P36517	319 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	CUE1	P38428	203 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	VMA21	P41806	77 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	NSE4	P43124	402 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YGR026W	P53217	278 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	TIM21	P53220	239 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YDR114C	Q04597	100 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	FCY2	P17064	533 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	CDC50	P25656	391 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	LAC1	P28496	418 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YGL262W	P53054	175 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YGR050C	P53231	118 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	PAU4	P53427	120 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ALG12	P53730	551 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ECM18	Q04623	453 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RXT3	Q07458	294 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	BOL1	Q3E793	110 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	ADE8	P04161	214 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YMR31	P19955	123 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	SEC59	P20048	519 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	CPR5	P35176	225 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YFL051C	P43552	160 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	YOS1	Q3E834	85 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MIA40	YKL195W	VPS63	O13549	108 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RPL39	P04650	51 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU1	P0CE88	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU14	P0CE89	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU6	P0CE90	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU18	P0CE91	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU8	P0CE92	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU11	P0CE93	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	QCR9	P22289	66 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	AHT1	P29589	182 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ACP1	P32463	125 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU13	P38725	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YHL037C	P38733	133 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	COX15	P40086	486 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	BNA2	P47125	453 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU10	Q03050	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	GAT3	Q07928	141 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU20	Q08322	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU9	Q3E770	120 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	CDC7	P06243	507 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	MIA40	P36046	403 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	MRPS9	P38120	278 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	TRS20	P38334	175 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	WSS1	P38838	269 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YGR269W	P40326	108 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PIR5	P46999	287 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DAN1	P47178	298 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YAP1802	P53309	568 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	HCH1	P53834	153 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	TMA10	Q06177	86 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DXO1	Q06349	442 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ARR3	Q06598	404 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		5.45	□□□□□ -1.54

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