RNA–Protein interactions for RNA: YDL208W

NHP2, Transcript of Protein related to mammalian high mobility group (HMG) proteins, yeastyeast

Gene NHP2, Length 471 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NHP2YDL208W VOA1P53262 265 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W SAY1P53324 424 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W MNT4P53745 580 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W LSM7P53905 115 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W BUD25P85052 153 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data0.66□□□□□ -2.3not detected
NHP2YDL208W CIK1Q01649 594 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W EST3Q03096 181 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W SNZ1Q03148 297 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W RSM10Q03201 203 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W DML1Q03652 475 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YDR249CQ03787 373 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W BNA7Q04066 261 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YDR391CQ04170 232 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W KRE28Q04431 385 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W MGR3Q04472 501 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W COX20Q04935 205 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W PEX10Q05568 337 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W DCR2Q05924 578 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W SYM1Q06563 197 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W ASR1Q06834 288 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W IRC19Q07843 230 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W MIM1Q08176 113 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YOR385WQ08909 290 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W AKR2Q12013 749 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W MDM32Q12171 622 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W ATP14Q12349 124 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W ISA2Q12425 185 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W HUT1Q12520 339 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YLR099W-AQ3E798 87 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W SUS1Q6WNK7 96 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YOS9Q99220 542 aa0.66□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.3
NHP2YDL208W YAL064W-BO13512 126 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W COX5BP00425 151 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SGA1P08019 549 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SPS2P08459 502 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SSA3P09435 649 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YGL041W-AP0C5N3 154 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W DSF1P0CX08 502 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YNR073CP0CX09 502 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YHR214C-DP0CX93 97 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W STE18P18852 110 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SEC22P22214 214 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MRS4P23500 304 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W IFM1P25038 676 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W OCH1P31755 480 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W PUP2P32379 260 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W KRE6P32486 720 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SPS18P32572 300 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W VAM7P32912 316 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SNC2P33328 115 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MRPS5P33759 307 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data0.65□□□□□ -2.31not detected
NHP2YDL208W MRPL3P36516 390 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MRPL39P36533 70 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YPC1P38298 316 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YBR242WP38331 238 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data0.65□□□□□ -2.31not detected
NHP2YDL208W YHL037CP38733 133 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SEN34P39707 275 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W HPA3P39979 161 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SMB1P40018 196 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W FMC1P40491 155 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W AVT7P40501 490 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SYS1P41544 203 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W GPI14P47088 403 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W DSK2P48510 373 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W BXI1P48558 297 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YGL159WP53110 370 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W OKP1P53298 406 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W PDR16P53860 351 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ALG9P53868 555 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W AAH1P53909 347 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YPL039WQ03080 316 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SDC1Q03323 175 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YDR102CQ03864 110 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W VBA1Q04301 562 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MIX14Q04341 121 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W COA4Q05809 96 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YLR283WQ05867 314 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CTS2Q06350 511 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W GPN3Q06543 272 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W FSH3Q99369 266 aa0.65□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YFR010W-AP0C5N0 62 aa0.64□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W GCN3P14741 305 aa0.64□□□□□ -2.31
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