RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 FESP07332 822 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RARGP13631 454 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 IL12RB1P42701 662 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EFNA5P52803 228 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 KCNMA1Q12791 1236 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DNAJC3Q13217 504 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PDIA5Q14554 519 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC153Q494R4 210 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MTERF2Q49AM1 385 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 BRINP3Q76B58 766 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CDH24Q86UP0 819 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MICU2Q8IYU8 434 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ADSSL1Q8N142 457 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 E2F7Q96AV8 911 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 BARHL2Q9NY43 387 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CEP152O94986 1710 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ABCA6Q8N139 1617 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CPDO75976 1380 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ANGPT2O15123 496 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PJA2O43164 708 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ALOX5P09917 674 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RIN3Q8TB24 985 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ANKS1AQ92625 1134 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TATDN2Q93075 761 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SPATA17Q96L03 361 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PPME1Q9Y570 386 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CLRN2A0PK11 232 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TAF4O00268 1085 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CES2O00748 559 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NPTXRO95502 500 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MAPK6Q16659 721 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 AIFM3Q96NN9 605 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RTN2O75298 545 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GDF11O95390 407 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ABL1P00519 1130 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HLA-DPA1P20036 260 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MCAMP43121 646 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEA4P43358 317 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ARSEP51690 589 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CHN2P52757 468 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PSMC5P62195 406 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SBK1Q52WX2 424 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 FANCEQ9HB96 536 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM165Q9HC07 324 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF302Q9NR11 478 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 POTEFA5A3E0 1075 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 POTEIP0CG38 1075 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 THRAP10827 490 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PYGMP11217 842 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 IFNA8P32881 189 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CBX3Q13185 183 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 XRCC4Q13426 336 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 LLGL1Q15334 1064 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 COA7Q96BR5 231 aa7.19□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CEP95Q96GE4 821 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms