RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593708.1

USF2-204, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-204ENST00000593708 TCHHQ07283 1943 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 HEPACAM2A8MVW5 462 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 SOAT2O75908 522 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 NFICP08651 508 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 PLCG1P19174 1290 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 SPATA1Q5VX52 437 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 JADE1Q6IE81 842 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 CENPPQ6IPU0 288 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 USP37Q86T82 979 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MYCT1Q8N699 235 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 AK8Q96MA6 479 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MTMR11A4FU01 709 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 OR6C75A6NL08 312 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 TISP43B9A030 160 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MAN2B1O00754 1011 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 CDR1P51861 262 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 LILRA4P59901 499 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MCM6Q14566 821 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 FAM3CQ92520 227 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 PARVGQ9HBI0 331 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 DLL3Q9NYJ7 618 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 TPRP12270 2363 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 SLC26A4O43511 780 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 FAM13AO94988 1023 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 TYMPP19971 482 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 UBA7P41226 1012 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 WDR44Q5JSH3 913 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 GAREM2Q75VX8 874 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 FAM212AQ96EL1 285 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 SENP8Q96LD8 212 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 NCDNQ9UBB6 729 aa23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ZNF263O14978 683 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 TRAK2O60296 914 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 EPHB3P54753 998 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 PLD1Q13393 1074 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 MYBPC2Q14324 1141 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 GAS6Q14393 721 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 KYAT1Q16773 422 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 RAD54LQ92698 747 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 CALML4Q96GE6 196 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 EPG5Q9HCE0 2579 aa23.39■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 PIRO00625 290 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 XPOTO43592 962 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ODC1P11926 461 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 CCNE1P24864 410 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 SOX9P48436 509 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ACOT2P49753 483 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 GTF2BQ00403 316 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 PSMG2Q969U7 264 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 BORCS6Q96GS4 357 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.38■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 OBSL1O75147 1896 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ANO9A1A5B4 782 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 CHRNB1P11230 501 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ALDH1A3P47895 512 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 MAMSTRQ6ZN01 415 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 GPR88Q9GZN0 384 aa23.37■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 ATF6P18850 670 aa23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 SCP2P22307 547 aa23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 TGM1P22735 817 aa23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 SATB1Q01826 763 aa23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.36■■□□□ 1.33
USF2-204ENST00000593708 USP49Q70CQ1 688 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms