RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 MAFFQ9ULX9 164 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 OR6C75A6NL08 312 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 HEPACAM2A8MVW5 462 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 H0YCG3 227 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 LILRB5O75023 590 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 FAM13AO94988 1023 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 TDGF1P13385 188 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 LILRA4P59901 499 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 WDR44Q5JSH3 913 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 IRF7Q92985 503 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 FAM212AQ96EL1 285 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 NELL2Q99435 816 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.14□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 PARVGQ9HBI0 331 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 OBSL1O75147 1896 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD63C9JTQ0 380 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 TRAK2O60296 914 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 UBA7P41226 1012 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 ACOT2P49753 483 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.13□□□□□ -0.31
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CTIF-208ENST00000590422 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZS52 159 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTIF-208ENST00000590422 SFR1Q86XK3 245 aa13.11□□□□□ -0.31
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