RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM199Q8N511 208 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 USP38Q8NB14 1042 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HASPINQ8TF76 798 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FNBP1Q96RU3 617 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RSAD1Q9HA92 442 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SIX2Q9NPC8 291 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 IL23AQ9NPF7 189 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SIX4Q9UIU6 781 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0U1RQF3 1178 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK13O15264 365 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HCRTO43612 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NOL4O94818 638 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GNA14O95837 355 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FGBP02675 491 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB1P05556 798 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FURINP09958 794 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOGP15173 224 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SCP2P22307 547 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PON1P27169 355 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PBX1P40424 430 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 BRCC3P46736 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RABGGTBP53611 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 BCAR1P56945 870 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM189BP81408 668 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ORC1Q13415 861 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NAB2Q15742 525 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB6Q15916 424 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 EPC2Q52LR7 807 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM240Q5SV17 173 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RRAGAQ7L523 313 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR49Q8IV35 697 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 VSTM4Q8IW00 320 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DRC7Q8IY82 874 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LMO3Q8TAP4 145 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CXorf38Q8TB03 319 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC51Q96ER9 411 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID3AQ99856 593 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SDCBP2Q9H190 292 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GANQ9H2C0 597 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DPP3Q9NY33 737 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GCNT4Q9P109 453 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTN3Q9P232 1028 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PCNTO95613 3336 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LCHNA4D1U4 455 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YGN5 161 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CBFA2T2O43439 604 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF623O75123 536 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 IL18RAPO95256 599 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNC2P02585 160 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNE1P15382 129 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RFC2P35250 354 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB27AP51159 221 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CLCNKBP51801 687 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH8P55286 799 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NCOA4Q13772 614 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GAS6Q14393 721 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SHHQ15465 462 aa6.49□□□□□ -1.37
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