RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SENP8Q96LD8 212 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SPAG5Q96R06 1193 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 GPR88Q9GZN0 384 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 POLIQ9UNA4 740 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 GBF1Q92538 1859 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 M0QZQ0 153 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TACC1O75410 805 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 KIF4AO95239 1232 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 LAG3P18627 525 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 STAT1P42224 750 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 Q7L0L9 218 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TC2NQ8N9U0 490 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA18Q8TC71 538 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 RABGGTAQ92696 567 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SUSD3Q96L08 255 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 DNAJC7Q99615 494 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 HCSTQ9UBK5 93 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 F8VZ95 297 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CYB561D2O14569 222 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TRAPPC3O43617 180 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 HUS1O60921 280 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CLSTN1O94985 981 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 FIBCD1Q8N539 461 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 MMS19Q96T76 1030 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ARID3AQ99856 593 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SDCBP2Q9H190 292 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 MARCH5Q9NX47 278 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TSC2P49815 1807 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 VWA8A3KMH1 1905 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC53A6NM62 1247 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TLL1O43897 1013 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TADA2AO75478 443 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 EFEMP2O95967 443 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CYP11A1P05108 521 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ITGB1P05556 798 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 WEE2P0C1S8 567 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SOX5P35711 763 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 INCA1Q0VD86 236 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 DEFB123Q8N688 67 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 APPL2Q8NEU8 664 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF558Q96NG5 402 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 PANX2Q96RD6 677 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 AAASQ9NRG9 546 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 CISHQ9NSE2 258 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SPNS1-210ENST00000568388 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 F8W810 466 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 LINC00271P0C7V0 271 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 TYMPP19971 482 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 BRCC3P46736 316 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 CDH8P55286 799 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 DSEQ9UL01 958 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 L1RE1Q9UN81 338 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 GABRDO14764 452 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 CILPO75339 1184 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC172P0C7W6 258 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 ODC1P11926 461 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 FERP16591 822 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 UNC93AQ86WB7 457 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 PDCL2Q8N4E4 241 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20■□□□□ 0.79
SPNS1-210ENST00000568388 IGSF21Q96ID5 467 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms