RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP72	Q9P209	647 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	DSE	Q9UL01	958 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CA14	Q9ULX7	337 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MYL4	P12829	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PNPLA4	P41247	253 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MRE11	P49959	708 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	EPHB3	P54753	998 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ASIC1	P78348	528 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PKP1	Q13835	747 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SV2C	Q496J9	727 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	BORCS6	Q96GS4	357 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SHD	Q96IW2	340 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ASAH2	Q9NR71	780 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.15	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		10.15	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH11	P35749	1972 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ECI2	O75521	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	VNN2	O95498	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGB3	P05106	788 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CEBPB	P17676	345 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CCR2	P41597	374 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	WNT7B	P56706	349 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PFKP	Q01813	784 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SURF1	Q15526	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	RESP18	Q5W5W9	173 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	WSCD1	Q658N2	575 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEH	Q6S545	545 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM209	Q96SK2	561 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	YIPF1	Q9Y548	306 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB3	Q9Y575	518 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	CIT	O14578	2027 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR11	A4FU01	709 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	HUS1	O60921	280 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT19	P08727	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	GJA1	P17302	382 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	AFM	P43652	599 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	EPHA5	P54756	1037 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	STARD6	P59095	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	RBP5	P82980	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SMARCB1	Q12824	385 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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