RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP1	P29466	404 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF6	P49848	677 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NHLH1	Q02575	133 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC13D	Q70J99	1090 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRX2	Q99811	253 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP72	Q9P209	647 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TWF1	Q12792	350 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF15	Q12870	199 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GPD1L	Q8N335	351 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM209	Q96SK2	561 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MICAL2	O94851	1124 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CFH	P08603	1231 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CCR2	P41597	374 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCN5	P51795	746 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NUBP1	P53384	320 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHA5	P54756	1037 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPP	Q6IPU0	288 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SIX5	Q8N196	739 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ING5	Q8WYH8	240 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CORO1B	Q9BR76	489 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GDE1	Q9NZC3	331 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	DSE	Q9UL01	958 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KRBA1	A5PL33	1030 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KPNA7	A9QM74	516 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB561D2	O14569	222 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFB1I1	O43294	461 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SLFN14	P0C7P3	912 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP4	Q13115	394 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL4B	Q13620	913 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MTSS1L	Q765P7	747 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR152	Q8TDT2	470 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM84A	Q96KN4	292 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF1	Q9Y548	306 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE4B	O95155	1302 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR11	A4FU01	709 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CEBPB	P17676	345 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CMA1	P23946	247 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MOSPD3	O75425	235 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB3	P05106	788 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPLA4	P41247	253 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	AFM	P43652	599 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SV2C	Q496J9	727 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	WSCD1	Q658N2	575 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ELMOD1	Q8N336	334 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF560	Q96MR9	790 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC3	Q9BY71	257 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SIX4	Q9UIU6	781 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HPSE	Q9Y251	543 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRJ	Q12913	1337 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF197	O14709	1029 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	AOC1	P19801	751 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN5	P54829	565 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GPC5	P78333	572 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCE	Q6IPM2	695 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	23.48	■■□□□ 1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LEMD2	Q8NC56	503 aa		23.48	■■□□□ 1.35

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