RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY6	O43306	1168 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ID4	P47928	161 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT5	P48643	541 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK3	P51956	506 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MST1L	Q2TV78	715 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	INAVA	Q3KP66	663 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	HYI	Q5T013	277 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf74	Q86VG3	221 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PDILT	Q8N807	584 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MDM1	Q8TC05	714 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	DPF1	Q92782	380 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	UROC1	Q96N76	676 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	WAC	Q9BTA9	647 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NEMP1	O14524	444 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TP73	O15350	636 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GAST	P01350	101 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SRGN	P10124	158 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HAL	P42357	657 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FHL1	Q13642	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ANO1	Q5XXA6	986 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CPA6	Q8N4T0	437 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF169	Q8NCN4	708 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HASPIN	Q8TF76	798 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF480	Q8WV37	535 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	USP7	Q93009	1102 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TBATA	Q96M53	351 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB6	Q9NWX5	421 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SCOC	Q9UIL1	159 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EDAR	Q9UNE0	448 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	IPP	Q9Y573	584 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HRG	P04196	525 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SETSIP	P0DME0	302 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	VDR	P11473	427 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP1	P22413	925 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINB3	P29508	390 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CRHR1	P34998	444 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FLT3LG	P49771	235 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT8	Q16880	541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT77	Q7Z794	578 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TPH2	Q8IWU9	490 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC89	Q8N998	374 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DDB2	Q92466	427 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAP2C	Q92754	450 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RGMA	Q96B86	450 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SKA1	Q96BD8	255 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SARAF	Q96BY9	339 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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