RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC26A3P40879 764 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 HADHAP40939 763 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 NUP107P57740 925 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 TTLQ8NG68 377 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 RMDN1Q96DB5 314 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CCDC138Q96M89 665 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 USP31Q70CQ4 1352 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 E9PMD0 336 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 FOXP2O15409 715 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 NMT2O60551 498 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CCDC22O60826 627 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 FOXN2P32314 431 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 NCOA4Q13772 614 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 SPA17Q15506 151 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 MAGEB18Q96M61 343 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC29A1Q99808 456 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 KLC2Q9H0B6 622 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 POLHQ9Y253 713 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 C4AP0C0L4 1744 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 C4BP0C0L5 1744 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 MAP3K6O95382 1288 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 RARGP13631 454 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 DNA2P51530 1060 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 KRT81Q14533 505 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 PPP2R5EQ16537 467 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 MMEL1Q495T6 779 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 C10orf82Q8WW14 230 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 MTMR9Q96QG7 549 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 GGA3Q9NZ52 723 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.59□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 BUB1O43683 1085 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 RHOBTB3O94955 611 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 KRT6AP02538 564 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 KRT6BP04259 564 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CYP21A2P08686 494 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CASP1P29466 404 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC29A2Q14542 456 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 MFSD5Q6N075 450 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 GPR141Q7Z602 305 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 FRS2Q8WU20 508 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 FMO2Q99518 471 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 USP40Q9NVE5 1235 aa11.58□□□□□ -0.55
SEMA4B-204ENST00000558065 CCRL2O00421 344 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 GPC4O75487 556 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 PIK3CAP42336 1068 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 SLCO1A2P46721 670 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 ATP6V0D1P61421 351 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 SPAG1Q07617 926 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 UBE3CQ15386 1083 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 TLR1Q15399 786 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 RGS21Q2M5E4 152 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 RFX8Q6ZV50 586 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 CYTH2Q99418 400 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 STK17AQ9UEE5 414 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 LGALS16A8MUM7 142 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 OLFM2O95897 454 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 RAP1GDS1P52306 607 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 EVA1CP58658 441 aa11.58□□□□□ -0.56
SEMA4B-204ENST00000558065 GNG2P59768 71 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms