RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 TCHPQ9BT92 498 aa21.18■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.18■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.18■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 C19orf81C9J6K1 198 aa21.18■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.18■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 POTEAQ6S8J7 498 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD248Q9HCU0 757 aa21.17■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 SCINQ9Y6U3 715 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIP14410 1827 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC89Q8N998 374 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.17■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADCY3O60266 1144 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 WEE2P0C1S8 567 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRAFP15056 766 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCD1P33897 745 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.16■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.16■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT1P04264 644 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ICAM3P32942 547 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM50Q86XT4 487 aa21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.16■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 CAV1Q03135 178 aa21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBR7Q8N806 425 aa21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 GGA3Q9NZ52 723 aa21.15■□□□□ 0.98
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AFG3L1P-217ENST00000557444 BTBD7Q9P203 1132 aa21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.15■□□□□ 0.98
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX3O60493 162 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSCO60682 206 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 OSTNP61366 133 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITIH4Q14624 930 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.14■□□□□ 0.97
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.14■□□□□ 0.97
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