RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP6O43182 974 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EPN2O95208 641 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GSTT1P30711 240 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 UBASH3AP57075 661 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FOXO4P98177 505 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SPIDRQ14159 915 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ADRM1Q16186 407 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 XKR3Q5GH77 459 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MAP4K1Q92918 833 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 THAP11Q96EK4 314 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MXD3Q9BW11 206 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SNX6Q9UNH7 406 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRB1O14514 1584 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MEGF6O75095 1541 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 A8MXQ7 604 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PDHXO00330 501 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ENC1O14682 589 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TBX3O15119 743 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA16P05015 189 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RALAP11233 206 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FGFR2P21802 821 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ATP1A2P50993 1020 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PLCB3Q01970 1234 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KRT73Q86Y46 540 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SPERTQ8NA61 448 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DNERQ8NFT8 737 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SLIT3O75094 1523 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRG0 241 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 E2F3O00716 465 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB39O15060 712 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HOXD12P35452 270 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PEX5P50542 639 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PTK2Q05397 1052 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LONP2Q86WA8 852 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 APPL2Q8NEU8 664 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PSKH2Q96QS6 385 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 OLFM1Q99784 485 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CENPOQ9BU64 300 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 APOL5Q9BWW9 433 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CYLDQ9NQC7 956 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 STAT5BP51692 787 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP4P98171 946 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 APOA5Q6Q788 366 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EDARQ9UNE0 448 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRQ8 180 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms