RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 MYO1EQ12965 1108 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 RNF169Q8NCN4 708 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF560Q96MR9 790 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 PPEF2O14830 753 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 P4HA1P13674 534 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 SYT11Q9BT88 431 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 KCND1Q9NSA2 647 aa23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2-202ENST00000546935 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 FOSL2P15408 326 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CLCN1P35523 988 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 IKBKEQ14164 716 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 MTF1Q14872 753 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 GRIN2CQ14957 1233 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 POLIQ9UNA4 740 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 MYO9BQ13459 2157 aa23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 HOXA2O43364 376 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 LCA5LO95447 670 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TAF6P49848 677 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF132P52740 706 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TUSC3Q13454 348 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 MYLIPQ8WY64 445 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 UROC1Q96N76 676 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NDUFA10O95299 355 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 POMCP01189 267 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 PAX3P23760 479 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TNNC1P63316 161 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 ARID5AQ03989 594 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 PTK2Q05397 1052 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 DSC1Q08554 894 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 SV2CQ496J9 727 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TTC39CQ8N584 583 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 URGCPQ8TCY9 931 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC42Q96M95 316 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 SDCBP2Q9H190 292 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CISHQ9NSE2 258 aa23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 PODXLO00592 558 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CYP26A1O43174 497 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 FGFR1P11362 822 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 INCA1Q0VD86 236 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 UPP1Q16831 310 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CASD1Q96PB1 797 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 COL4A6Q14031 1691 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 KPNA7A9QM74 516 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 SPTLC1O15269 473 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM163BP0C2L3 166 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 CLCNKBP51801 687 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF11P52732 1056 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 RABGGTBP53611 331 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 BPIFB4P59827 614 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 LILRA4P59901 499 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 NENFQ9UMX5 172 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.35■■□□□ 1.33
CSRNP2-202ENST00000546935 EYSQ5T1H1 3165 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms