RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MYBL1P10243 752 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA10Q16322 511 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC4Q96A65 974 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SPOPO43791 374 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 FKTNO75072 461 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CALCAP01258 141 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MCF2P10911 925 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GYS2P54840 703 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM270Q6UE05 265 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT35Q92764 455 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM212AQ96EL1 285 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 AMACRQ9UHK6 382 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIN2DO15399 1336 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC66A2RUB6 948 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 AGPSO00116 658 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF40O75150 1001 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL8P10145 99 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA6P17066 643 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC42EP1Q00587 391 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CD101Q93033 1021 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 HSF2BPO75031 334 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ERLIN2O94905 339 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GNRH1P01148 92 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM153BP0C7A2 387 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 STAG3L1P0CL83 205 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GNAT1P11488 350 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX5P50542 639 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM153CQ494X1 144 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 WNT8BQ93098 351 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CTNNA2P26232 953 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 GNA15P30679 374 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPCQ03188 943 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TRADDQ15628 312 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NAA35Q5VZE5 725 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MREGQ8N565 214 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 BTBD6Q96KE9 485 aa21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCKSL1P49006 195 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX17Q15036 470 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RUFY1Q96T51 708 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NR2E1Q9Y466 385 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 OPA1O60313 960 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 GUCY2FP51841 1108 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LACTBL1A8MY62 500 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TTI1O43156 1089 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 B4GALT4O60513 344 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 INHAP05111 366 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPC3Q13507 836 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LIN9Q5TKA1 542 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NME8Q8N427 588 aa21.55■■□□□ 1.04
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