RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC01553A4QN01 128 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CSPG5O95196 566 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF394Q53GI3 561 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 TDHQ8IZJ6 230 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP72Q9P209 647 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 NME7Q9Y5B8 376 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 IGSF21Q96ID5 467 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 PBX4Q9BYU1 374 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 LAG3P18627 525 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 BMP8BP34820 402 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 MFAP3P55082 362 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 GCNT1Q02742 428 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 ARID5AQ03989 594 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP57Q86XR8 500 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 BCO2Q9BYV7 579 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CERS4Q9HA82 394 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CISHQ9NSE2 258 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC53A6NM62 1247 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 HUS1O60921 280 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 FUT10Q6P4F1 479 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 APPL2Q8NEU8 664 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAG5Q96R06 1193 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 NUP58Q9BVL2 599 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT5P13647 590 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 P4HA1P13674 534 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 LMO2P25791 158 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 OSTM1Q86WC4 334 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SUSD3Q96L08 255 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TWNKQ96RR1 684 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 STK33Q9BYT3 514 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 F8VZ95 297 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PDGFRBP09619 1106 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT9P35527 623 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 JAM2P57087 298 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM270Q6UE05 265 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PRO3102Q9H379 93 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SPG21Q9NZD8 308 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 GFPT2O94808 682 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CTNNB1P35222 781 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC142Q17RM4 750 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 FIGNQ5HY92 759 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 M0QZQ0 153 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PDXDC1Q6P996 788 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 UBR7Q8N806 425 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SHC3Q92529 594 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP26A1O43174 497 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 MFAP3LO75121 409 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 NDST1P52848 882 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 WHAMMQ8TF30 809 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM169Q96HH4 297 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.483e-8■■■■■ 249.9
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQJ5 194 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM170AA1A519 330 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF18O76093 207 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ODC1P11926 461 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 BMPR1AP36894 532 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 RTP2Q5QGT7 225 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms