RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TICAM2Q86XR7 235 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.04□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.04□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 GYG1P46976 350 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 MCL1Q07820 350 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CERS5Q8N5B7 392 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR8Q96EF0 704 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 GBP4Q96PP9 640 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 JADE2Q9NQC1 790 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.03□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 MYH2Q9UKX2 1941 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF839A8K0R7 811 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 B4GALT4O60513 344 aa5.02□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 USP14P54578 494 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SESN3P58005 492 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 HERVK_113P62684 666 aa5.02□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 EPHA7Q15375 998 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 USP51Q70EK9 711 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 PALM2Q8IXS6 379 aa5.02□□□□□ -1.61
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