RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, human

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPB2-208	ENST00000512153	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
COPB2-208	ENST00000512153	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
COPB2-208	ENST00000512153	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPB2-208	ENST00000512153	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
COPB2-208	ENST00000512153	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
COPB2-208	ENST00000512153	NID2	Q14112	1375 aa		11.65	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153		K7ERI5	159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	EGF	P01133	1207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	DRD1	P21728	446 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PSMA5	P28066	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TXK	P42681	527 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	NAMPT	P43490	491 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	MAPK8	P45983	427 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	MCM2	P49736	904 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	EFNA5	P52803	228 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	LMAN2	Q12907	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	RUNX3	Q13761	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CALCRL	Q16602	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ITIH5	Q86UX2	942 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	COL4A2	P08572	1712 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153		H0Y626	953 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	MAP3K13	O43283	966 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TRIM16	O95361	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	GALK1	P51570	392 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	STK3	Q13188	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	DMC1	Q14565	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	NPY5R	Q15761	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ACD	Q96AP0	544 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	AVPR1A	P37288	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	GRM5	P41594	1212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CYP4F8	P98187	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	BFSP1	Q12934	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CEP120	Q8N960	986 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	EDN1	P05305	212 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPB2-208	ENST00000512153	KCNE1	P15382	129 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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