RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	RHO	P08100	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CNGA1	P29973	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SNX19	Q92543	992 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PRKCG	P05129	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CPE	P16870	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TLE1	Q04724	770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	RFK	Q969G6	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NR2F6	P10588	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NPTX2	P47972	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	F2RL2	O00254	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TP73	O15350	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ORC4	O43929	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	MT-CO1	P00395	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SOX10	P56693	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ACAP2	Q15057	778 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	COA7	Q96BR5	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268		F5H697	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SGTA	O43765	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NXPH1	P58417	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	DSC2	Q02487	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268		A0A0B4J269	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268		E7ENX8	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	FZD9	O00144	591 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	JUP	P14923	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PHKA1	P46020	1223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TAP2	Q03519	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ITIH3	Q06033	890 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PIGF	Q07326	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TUBB3	Q13509	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	RAB39A	Q14964	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PBK	Q96KB5	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SMO	Q99835	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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