RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE1BQ01064 536 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BLMHQ13867 455 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS36Q86VN1 386 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SCFD2Q8WU76 684 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FRMD6Q96NE9 622 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZPBPQ9BS86 351 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NTN4Q9HB63 628 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PRG0 241 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KRIT1O00522 736 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKAB2O43741 272 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX10O60683 326 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CBFA2T3O75081 653 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 USP46P62068 366 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PLIN5Q00G26 463 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SULT2A1Q06520 285 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF5AQ12840 1032 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SGCGQ13326 291 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MOGQ16653 247 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KDELC1Q6UW63 502 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPV1Q8NER1 839 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ESR2Q92731 530 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KIFAP3Q92845 792 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SGK3Q96BR1 496 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 APOL5Q9BWW9 433 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EHD2Q9NZN4 543 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFATQ9P243 1243 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS18Q9P253 973 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMB1P07942 1786 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP290O15078 2479 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SNPHO15079 494 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RASSF9O75901 435 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF18O76093 207 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCY5O95622 1261 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PDHBP11177 359 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SYT1P21579 422 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IL32P24001 234 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINB3P29508 390 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PTGS2P35354 604 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EVCP57679 992 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 JAG1P78504 1218 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKCEQ02156 737 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PPARAQ07869 468 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAIQ8N9R8 606 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RELTQ969Z4 430 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KAT14Q9H8E8 782 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EURLQ9NYK6 297 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BQF6 201 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BIRC5O15392 142 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MGRN1O60291 552 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2G6O60733 806 aa4.84□□□□□ -1.63
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