RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 M0R2N6 131 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SLITRK3O94933 977 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 EGFP01133 1207 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CPA1P15085 419 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DRD1P21728 446 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 GABRR2P28476 465 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CDC25CP30307 473 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 AVPR1AP37288 418 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 NAMPTP43490 491 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 OSTNP61366 133 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 IRX4P78413 519 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 BFSP1Q12934 665 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 RUNX3Q13761 415 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DMC1Q14565 340 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PMS2CLQ68D20 193 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SYT13Q7L8C5 426 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TMC8Q8IU68 726 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PIGKQ92643 395 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DDX12PQ92771 950 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 HAS1Q92839 578 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SPACA7Q96KW9 195 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SUSD3Q96L08 255 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 NACC1Q96RE7 527 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TASP1Q9H6P5 420 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 GKN1Q9NS71 199 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 EBF1Q9UH73 591 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 OR6C75A6NL08 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PATE3B3GLJ2 98 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PRAMEF12O95522 483 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 GRM5P41594 1212 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DPP6P42658 865 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DUSP4Q13115 394 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CALCRLQ16602 461 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ANO7Q6IWH7 933 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 GAREM2Q75VX8 874 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TTC30AQ86WT1 665 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CPA6Q8N4T0 437 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PSMG2Q969U7 264 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ACAP3Q96P50 834 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 EBF3Q9H4W6 596 aa6.72□□□□□ -1.33
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CBX1-205ENST00000495350 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 INVSQ9Y283 1065 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 USP20Q9Y2K6 914 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ITPR1Q14643 2758 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.71□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 NUP205Q92621 2012 aa6.71□□□□□ -1.33
CBX1-205ENST00000495350 K7ERI5 159 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MAP3K13O43283 966 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NEMFO60524 1076 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CDKL5O76039 1030 aa6.71□□□□□ -1.34
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