RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.97■□□□□ 0.15
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ACTB-213ENST00000493945 GLUD2P49448 558 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-213ENST00000493945 TSPY1Q01534 308 aa15.97■□□□□ 0.15
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ACTB-213ENST00000493945 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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ACTB-213ENST00000493945 ASPAP45381 313 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-213ENST00000493945 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 LMO3Q8TAP4 145 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-213ENST00000493945 FAM84AQ96KN4 292 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 A0A1W2PQJ5 194 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 A8MXQ7 604 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 SPTLC1O15269 473 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 TEX33O43247 280 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 ITGB1P05556 798 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-213ENST00000493945 CTSAP10619 480 aa15.93■□□□□ 0.14
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