RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PIGKQ92643 395 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 HAS1Q92839 578 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DYDC2Q96IM9 177 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GKN1Q9NS71 199 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DKK4Q9UBT3 224 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TBX20Q9UMR3 447 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 USP20Q9Y2K6 914 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MGAQ8IWI9 3026 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PTPRBP23467 1997 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TNFRSF10BO14763 440 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DGAT1O75907 488 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SLITRK3O94933 977 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LYPLA2O95372 231 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CD59P13987 128 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MAPK8P45983 427 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MCM2P49736 904 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PTPAQ15257 358 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NPY5RQ15761 445 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FBXO43Q4G163 708 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 XKR4Q5GH76 650 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GPR158Q5T848 1215 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SLC39A7Q92504 469 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FAM20AQ96MK3 541 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FNBP1Q96RU3 617 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GDAQ9Y2T3 454 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NID2Q14112 1375 aa7.92□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 COL12A1Q99715 3063 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WV48 116 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PODXLO00592 558 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PTGER3P43115 390 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RARRES1P49788 294 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CYP4A11Q02928 519 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SYT12Q8IV01 421 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RIN3Q8TB24 985 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DDX12PQ92771 950 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PSMG2Q969U7 264 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SUSD3Q96L08 255 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 EBF3Q9H4W6 596 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TASP1Q9H6P5 420 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 IL21Q9HBE4 155 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.91□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PTPN13Q12923 2485 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 KNTC1P50748 2209 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ANTXRLA6NF34 631 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ACKR2O00590 384 aa7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CDC45O75419 566 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms