RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IKBKB	O14920	756 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZMYND10	O75800	440 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AKAP3	O75969	853 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNNC2	P02585	160 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ODC1	P11926	461 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OR1D2	P34982	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MTHFR	P42898	656 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ROR1	Q01973	937 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZP2	Q05996	745 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PALB2	Q86YC2	1186 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WDR27	A2RRH5	827 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CYB561D2	O14569	222 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM163B	P0C2L3	166 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATF2	P15336	505 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCNE1	P24864	410 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ADAM9	Q13443	819 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZACN	Q401N2	412 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CES5A	Q6NT32	575 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GABRD	O14764	452 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PSMA7	O14818	248 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CETN3	O15182	167 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RFPL2	O75678	378 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VNN2	O95498	520 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNNI1	P19237	187 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATIC	P31939	592 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VAMP7	P51809	220 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DLG4	P78352	724 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BFSP1	Q12934	665 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPR17	Q13304	367 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STIM1	Q13586	685 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WSCD1	Q658N2	575 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	USP37	Q86T82	979 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		10.19	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms