RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 TPGS2Q68CL5 300 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 WDR49Q8IV35 697 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ELMOD1Q8N336 334 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 INTS13Q9NVM9 706 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 USTQ9Y2C2 406 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 SPTLC1O15269 473 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 HUS1O60921 280 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 OAZ2O95190 189 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ATF2P15336 505 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 HOXA9P31269 272 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CYP24A1Q07973 514 aa22.09■■□□□ 1.13
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SCAF8-204ENST00000461219 KCNB1Q14721 858 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RTL10Q7L3V2 364 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PDXKO00764 312 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PHACTR2O75167 634 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PSMD6Q15008 389 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CEP135Q66GS9 1140 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.132e-8■■■□□ 16.6
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SCAF8-204ENST00000461219 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CGRRF1Q99675 332 aa22.08■■□□□ 1.13
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SCAF8-204ENST00000461219 TBC1D4O60343 1298 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ABLIM3O94929 683 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 NR3C1P04150 777 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 OR4Q2P0C623 313 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 FSHRP23945 695 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 MAFFQ9ULX9 164 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TRPC3Q13507 836 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 MYBPC2Q14324 1141 aa22.06■■□□□ 1.12
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SCAF8-204ENST00000461219 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 HPDLQ96IR7 371 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 FAM84AQ96KN4 292 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TIGD1Q96MW7 591 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.06■■□□□ 1.12
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SCAF8-204ENST00000461219 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.05■■□□□ 1.12
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SCAF8-204ENST00000461219 MYL7Q01449 175 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 GPR17Q13304 367 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 PLD1Q13393 1074 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 PTPN21Q16825 1174 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.04■■□□□ 1.12
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SCAF8-204ENST00000461219 SEC24AO95486 1093 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 NR2F2P24468 414 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 NTHL1P78549 312 aa22.03■■□□□ 1.12
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SCAF8-204ENST00000461219 MTMR3Q13615 1198 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 MMS19Q96T76 1030 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TSG101Q99816 390 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 CORO1BQ9BR76 489 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 SIX4Q9UIU6 781 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 MUC3AQ02505 3323 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ASGR2P07307 311 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 POU2F2P09086 479 aa22.02■■□□□ 1.12
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