RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460900.1

CRIP1-204, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CRIP1, Length 1,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-204ENST00000460900 CPB1P15086 417 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 PTPRJQ12913 1337 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 RTL10Q7L3V2 364 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 METTL23Q86XA0 190 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 SMARCE1Q969G3 411 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 BORCS6Q96GS4 357 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.64■■□□□ 1.54
CRIP1-204ENST00000460900 OR6C75A6NL08 312 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CYP11A1P05108 521 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ATF2P15336 505 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 MYBPC2Q14324 1141 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 TPGS2Q68CL5 300 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CXorf38Q8TB03 319 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CGRRF1Q99675 332 aa24.63■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 HOXA9P31269 272 aa24.62■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 BFSP1Q12934 665 aa24.62■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 RNF135Q8IUD6 432 aa24.62■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 SIX4Q9UIU6 781 aa24.62■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PRRG1O14668 218 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 XYLBO75191 536 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 UBE2HP62256 183 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 MYO1EQ12965 1108 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 SPATA20Q8TB22 786 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CYP4F11Q9HBI6 524 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 POLIQ9UNA4 740 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 USTQ9Y2C2 406 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 HUS1O60921 280 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ADCY1Q08828 1119 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 WSCD1Q658N2 575 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CEP135Q66GS9 1140 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 MAFFQ9ULX9 164 aa24.61■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 DENND4AQ7Z401 1863 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CLUHO75153 1309 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CCL16O15467 120 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 OR4Q2P0C623 313 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 NR2F2P24468 414 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 CASP4P49662 377 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 NFIL3Q16649 462 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 HPDLQ96IR7 371 aa24.6■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 SEC24AO95486 1093 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 LRG1P02750 347 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ALADP13716 330 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 GPR17Q13304 367 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 MYO10Q9HD67 2058 aa24.59■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 TSC2P49815 1807 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 POU2F2P09086 479 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PRCPP42785 496 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF516Q92618 1163 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 EPHX3Q9H6B9 360 aa24.58■■□□□ 1.53
CRIP1-204ENST00000460900 DCXO43602 365 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 AP3M2P53677 418 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 ADAM9Q13443 819 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 TMEM209Q96SK2 561 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 L1RE1Q9UN81 338 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 INSL5Q9Y5Q6 135 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 PHACTR2O75167 634 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 TRPC3Q13507 836 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-204ENST00000460900 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms