RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455474.5

CCDC18-AS1-221, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 299 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.9□□□□□ -1.63
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CCDC18-AS1-221ENST00000455474 CHPFQ8IZ52 775 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 NME8Q8N427 588 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 SEMA4DQ92854 862 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 JAKMIP2Q96AA8 810 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 MFSD3Q96ES6 412 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 SHDQ96IW2 340 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 CAPNS2Q96L46 248 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 NT5C1BQ96P26 610 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-221ENST00000455474 FNBP1Q96RU3 617 aa4.89□□□□□ -1.63
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