RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGB4P16144 1822 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C21orf2O43822 256 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DGAT1O75907 488 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOBTB3O94955 611 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT16P08779 473 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RBP3P10745 1247 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 VCAM1P19320 739 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FMO5P49326 533 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 STK4Q13043 487 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 VEPH1Q14D04 833 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX9Q8N6V9 391 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC100653049A0A140TA62 436 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT34O76011 436 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CPB1P15086 417 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIN1Q05586 938 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KYAT1Q16773 422 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ELMOD1Q8N336 334 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 URGCPQ8TCY9 931 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 USP6NLQ92738 828 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRN2Q92932 1015 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 HIC2Q96JB3 615 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf58C9J3I9 102 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAPO00193 183 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP27B1O15528 508 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 COPB2P35606 906 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFA1P59665 94 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFA3P59666 94 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNE4Q8N205 404 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ERP44Q9BS26 406 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TASP1Q9H6P5 420 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP9O95302 570 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 WEE2P0C1S8 567 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RALAP11233 206 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LCP1P13796 627 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf89Q6UX73 402 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TC2NQ8N9U0 490 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RFWD2Q8NHY2 731 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT35Q92764 455 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TIPINQ9BVW5 301 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D4O60343 1298 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCY1A2P33402 732 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA4P43358 317 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PTK7Q13308 1070 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1I3Q14994 352 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LDHDQ86WU2 507 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 P3H2Q8IVL5 708 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKS1AQ92625 1134 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ABHD8Q96I13 439 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZIM3Q96PE6 472 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT7Q99832 543 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PAK5Q9P286 719 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NARFQ9UHQ1 456 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC78A2IDD5 438 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD3O43242 534 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms