RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ADCY3O60266 1144 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 IFT88Q13099 833 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 SURF1Q15526 300 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 LRRC38Q5VT99 294 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CCDC89Q8N998 374 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CHST7Q9NS84 486 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 PTPRJQ12913 1337 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TLDC2A0PJX2 215 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TTC4O95801 387 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TGFB3P10600 412 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 FGFR4P22455 802 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 EDNRBP24530 442 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 WNT7BP56706 349 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 WDR49Q8IV35 697 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 THAP12O43422 761 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 GHRP10912 638 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ATF2P15336 505 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 SP4Q02446 784 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 NEDD9Q14511 834 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 QPCTQ16769 361 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TMEM270Q6UE05 265 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MAFO75444 373 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TAP1Q03518 808 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 IFNL1Q8IU54 200 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 FAM167AQ96KS9 214 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 OSBPL8Q9BZF1 889 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TRIM7Q9C029 511 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 KDM4CQ9H3R0 1056 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 NDC80O14777 642 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CALB1P05937 261 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MMP8P22894 467 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 COPS2P61201 443 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MCL1Q07820 350 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 NOGQ13253 232 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 NCOA4Q13772 614 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ITIH4Q14624 930 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MDM1Q8TC05 714 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 SCLT1Q96NL6 688 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.21■■□□□ 1.63
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PMS1-205ENST00000409985 TM4SF4P48230 202 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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PMS1-205ENST00000409985 LBX2Q6XYB7 198 aa25.21■■□□□ 1.63
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PMS1-205ENST00000409985 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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PMS1-205ENST00000409985 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 BTBD7Q9P203 1132 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 NUB1Q9Y5A7 615 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CNMDO75829 334 aa25.21■■□□□ 1.63
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PMS1-205ENST00000409985 ITGA8P53708 1063 aa25.21■■□□□ 1.63
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PMS1-205ENST00000409985 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TOM1L1O75674 476 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SNX1Q13596 522 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CAPSQ13938 189 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 IER5Q5VY09 327 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ZNF365Q70YC5 407 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ANKS4BQ8N8V4 417 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.2■■□□□ 1.62
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