RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PQ64 194 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PQD8 194 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 MYL1P05976 194 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 SYKP43405 635 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR17Q13304 367 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 MYBPC2Q14324 1141 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 DSEQ9UL01 958 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH7Q9ULB5 785 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 KPNA7A9QM74 516 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 CYB561D2O14569 222 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 OR4Q2P0C623 313 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPN2P17706 415 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 PNPLA4P41247 253 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFA8P51970 172 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 SURF1Q15526 300 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 SV2CQ496J9 727 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXL6Q8N531 539 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 CXorf38Q8TB03 319 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 ITFG1Q8TB96 612 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF13Q92913 245 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF560Q96MR9 790 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 ANHXE9PGG2 379 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 VNN2O95498 520 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGB3P05106 788 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 RHOP08100 348 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 NUCB2P80303 420 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD2Q13200 908 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 INTS13Q9NVM9 706 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3-201ENST00000392415 CLIC2O15247 247 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 STK4Q13043 487 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 HTR4Q13639 388 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL23Q86XA0 190 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 FSIP1Q8NA03 581 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOC1Q9NV70 894 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 TWF1Q12792 350 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP4Q13115 394 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 WSCD1Q658N2 575 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CENPPQ6IPU0 288 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM84AQ96KN4 292 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM209Q96SK2 561 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP72Q9P209 647 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 SIX4Q9UIU6 781 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRJQ12913 1337 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR11A4FU01 709 aa22.18■■□□□ 1.14
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UBE2E3-201ENST00000392415 RBP5P82980 135 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 IQCEQ6IPM2 695 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR49Q8IV35 697 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 ELMOD1Q8N336 334 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 RDH13Q8NBN7 331 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF14Q92915 247 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 CORO1BQ9BR76 489 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNH6Q9H252 994 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 YIPF1Q9Y548 306 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3-201ENST00000392415 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.18■■□□□ 1.14
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