RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 GCNT1Q02742 428 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 MCUR1Q96AQ8 359 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 HESX1Q9UBX0 185 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 H0Y3Z8 333 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 MED7O43513 233 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 PRPSAP2O60256 369 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CYP1A2P05177 515 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NCKAP1LP55160 1127 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TAS2R40P59535 323 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 HIF1AQ16665 826 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 VPS52Q8N1B4 723 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 RDM1Q8NG50 284 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 UBA3Q8TBC4 463 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ELP3Q9H9T3 547 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SLC8A1P32418 973 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ABCD1P33897 745 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CLCN3P51790 818 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CDH6P55285 790 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ARL4CP56559 192 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 STAT4Q14765 748 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NFIL3Q16649 462 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 KAT2BQ92831 832 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 MIS12Q9H081 205 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CREB1P16220 341 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CDH8P55286 799 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 MYO1EQ12965 1108 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 LY6KQ17RY6 165 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 FAF2Q96CS3 445 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 PGM2Q96G03 612 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 GPR88Q9GZN0 384 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CISHQ9NSE2 258 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 WHRNQ9P202 907 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF536O15090 1300 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 UBOX5O94941 541 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 PCK1P35558 622 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TNFSF9P41273 254 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ERFP50548 548 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF677Q86XU0 584 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 RILPQ96NA2 401 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 O00370 1275 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 GLRA2P23416 452 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 DSG3P32926 999 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SERPINB12Q96P63 405 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 BTAF1O14981 1849 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 C19orf81C9J6K1 198 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TBC1D12O60347 775 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 PTPRAP18433 802 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 NAMPTP43490 491 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 Q3C1V9 767 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 PPM1NQ8N819 430 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 LMO3Q8TAP4 145 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 SGSM3Q96HU1 749 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ZBED1O96006 694 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 GJB1P08034 283 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 ECHS1P30084 290 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF549-202ENST00000376233 CENPCQ03188 943 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms