RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CHST12Q9NRB3 414 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DERAQ9Y315 318 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CKBP12277 381 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KRT83P78385 493 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PTK2Q05397 1052 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ADCY2Q08462 1091 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRPC3Q13507 836 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 LPIN1Q14693 890 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 APOL6Q9BWW8 343 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C2CD2Q9Y426 696 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HES2Q9Y543 173 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IPPQ9Y573 584 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 A0A0U1RQJ8 604 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AKR1B10O60218 316 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GCKP35557 465 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GJA8P48165 433 aa6.47□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PAK2Q13177 524 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SHC3Q92529 594 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KIF12Q96FN5 646 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZNF333Q96JL9 665 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CNTN3Q9P232 1028 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZNF263O14978 683 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RECQL4O94761 1208 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GHRP10912 638 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AKAP5P24588 427 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CD52P31358 61 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PEX19P40855 299 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CUL2Q13617 745 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SPA17Q15506 151 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 PADI3Q9ULW8 664 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SQORQ9Y6N5 450 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KRT19P08727 400 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FOSL1P15407 271 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ANXA13P27216 316 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CYP27A1Q02318 531 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DEUP1Q05D60 604 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRIP11Q15643 1979 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PTPN14Q15678 1187 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RNF39Q9H2S5 420 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PARP2Q9UGN5 583 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.46□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.46□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 LBX1P52954 281 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 DSC3Q14574 896 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SLC18A3Q16572 532 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZNF699Q32M78 642 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1328Q86T90 577 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 USP38Q8NB14 1042 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CAGE1Q8TC20 777 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SYT11Q9BT88 431 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.46□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.46□□□□□ -1.38
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