RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PPTC7Q8NI37 304 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DDI1Q8WTU0 396 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ZNF333Q96JL9 665 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 AK8Q96MA6 479 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KIFC3Q9BVG8 833 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KBTBD4Q9NVX7 518 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SEPT3Q9UH03 358 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SERTAD1Q9UHV2 236 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NCOR1O75376 2440 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 BECN2A8MW95 431 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PPP1R37O75864 691 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ERLIN2O94905 339 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 F2P00734 622 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GH1P01241 217 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 LGALS2P05162 132 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ASGR1P07306 291 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MMP3P08254 477 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TXLNAP40222 546 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 AFMP43652 599 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SOX10P56693 466 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PPP2R5DQ14738 602 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KRT79Q5XKE5 535 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PDXDC2PQ6P474 469 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RFX8Q6ZV50 586 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DAW1Q8N136 415 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PGBD3Q8N328 593 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TTC17Q96AE7 1141 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARMC5Q96C12 935 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 VPS39Q96JC1 886 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CCDC138Q96M89 665 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 APOL5Q9BWW9 433 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PATJQ8NI35 1801 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 EBAG9O00559 213 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NOP56O00567 594 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 BACH1O14867 736 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KPNA6O60684 536 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN9O75954 239 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SLFN14P0C7P3 912 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARL3P36405 182 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MSH2P43246 934 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GJA9P57773 515 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MAPK7Q13164 816 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 STARD3Q14849 445 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARHGEF6Q15052 776 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KCNA10Q16322 511 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 VSIG1Q86XK7 387 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 C4orf19Q8IY42 314 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CEP112Q8N8E3 955 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 EPS8L1Q8TE68 723 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GLG1Q92896 1179 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NACA2Q9H009 215 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.32□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MYMKA6NI61 221 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RSPH10B2B2RC85 870 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 HAS3O00219 553 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DAPK3O43293 454 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KCNH1O95259 989 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PYGLP06737 847 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GJB1P08034 283 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RSPH10BP0C881 870 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PF4V1P10720 104 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RARBP10826 455 aa3.31□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CYP11B2P19099 503 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms