RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PARP2Q9UGN5 583 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 IPPQ9Y573 584 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ALG6Q9Y672 507 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 BRCA2P51587 3418 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 FKTNO75072 461 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CABYRO75952 493 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MYO1EQ12965 1108 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ITGA7Q13683 1181 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MON1BQ7L1V2 547 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TFAP2BQ92481 460 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 KLK14Q9P0G3 267 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RRM1P23921 792 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 THPOP40225 353 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ACLYP53396 1101 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TNNC1P63316 161 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MGAT3Q09327 533 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF6Q15052 776 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RNF19AQ9NV58 838 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CILPO75339 1184 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 INHAP05111 366 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PAEPP09466 180 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RAD23BP54727 409 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C2orf54Q08AI8 447 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MESDQ14696 234 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C2CD6Q53TS8 623 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 XKR4Q5GH76 650 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 WHAMMQ8TF30 809 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.42■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 KCNE1P15382 129 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 YY1P25490 414 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CHST12Q9NRB3 414 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CD19P15391 556 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 LIN9Q5TKA1 542 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TWNKQ96RR1 684 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.41■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PPEF2O14830 753 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 GPR182O15218 404 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MED7O43513 233 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CEP104O60308 925 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PTP4A2Q12974 167 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PTK7Q13308 1070 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 LHX8Q68G74 356 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TTC39CQ8N584 583 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 BTBD6Q96KE9 485 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 NOD1Q9Y239 953 aa20.4■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CD4P01730 458 aa20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.9 ms