RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311177.6

HOXB9-201, Transcript of homeobox B9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB9, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9-201ENST00000311177 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CAND2O75155 1236 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CYP1A2P05177 515 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PRKCBP05771 671 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 KCNJ2P63252 427 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 RIPK1Q13546 671 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CUL2Q13617 745 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TMEM270Q6UE05 265 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ARMCX2Q7L311 632 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PASD1Q8IV76 773 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 GGT7Q9UJ14 662 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC188H7C350 402 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 FAM189A1O60320 539 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 OSTNP61366 133 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM7Q9C029 511 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 DPH5Q9H2P9 285 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 GLTPD2A6NH11 291 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 B4GALT5O43286 388 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TOM1L1O75674 476 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 EFNA5P52803 228 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 NCOA4Q13772 614 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TCEAL1Q15170 157 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 LLGL1Q15334 1064 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MAPK6Q16659 721 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ZPBP2Q6X784 338 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 GSTA1P08263 222 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TTLL4Q14679 1199 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SPOPO43791 374 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MTA2O94776 668 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TLCD1Q96CP7 247 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SH3GL3Q99963 347 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PDHXO00330 501 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ADORA2AP29274 412 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 CFAP73A6NFT4 308 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SMIM23A6NLE4 172 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 SHBGP04278 402 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 RRM1P23921 792 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PEX5P50542 639 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ITIH4Q14624 930 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MORC4Q8TE76 937 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 TLDC2A0PJX2 215 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ABLIM1O14639 778 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 ASAP2O43150 1006 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 PYGMP11217 842 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB9-201ENST00000311177 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms