RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 FMO5P49326 533 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF165P49910 485 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 CDH8P55286 799 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 MYL5Q02045 173 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 KRT39Q6A163 491 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 GLP2RO95838 553 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ATP1A3P13637 1013 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 EPCAMP16422 314 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 OR1D2P34982 312 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 PNPLA4P41247 253 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 AP3M2P53677 418 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 MYO1EQ12965 1108 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 USP37Q86T82 979 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 OR10T2Q8NGX3 314 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 LMO3Q8TAP4 145 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 PLXNA3P51805 1871 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 HUS1O60921 280 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ATP2C2O75185 946 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 CLSTN1O94985 981 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 WEE2P0C1S8 567 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF18P17022 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 TYMPP19971 482 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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