RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 TRIM32Q13049 653 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 FUT8Q9BYC5 575 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 RNF19AQ9NV58 838 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SASH3O75995 380 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MARCKSL1P49006 195 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 HDXQ7Z353 690 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 TFAP2BQ92481 460 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 TRIM7Q9C029 511 aa15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 AKAP5P24588 427 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GJA9P57773 515 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 KRT222Q8N1A0 295 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 NME8Q8N427 588 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 BCO2Q9BYV7 579 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SDCBP2Q9H190 292 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 L1RE1Q9UN81 338 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ITGA4P13612 1032 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 AXLP30530 894 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GUCY2DQ02846 1103 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MYO1EQ12965 1108 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 AADACL2Q6P093 401 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 DPH6Q7L8W6 267 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CXorf38Q8TB03 319 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ZBTB9Q96C00 473 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PARP2Q9UGN5 583 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.54■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CCDC66A2RUB6 948 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CCDC188H7C350 402 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 M0QZ92 97 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SEPT4O43236 478 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MED7O43513 233 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 KLK14Q9P0G3 267 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CITO14578 2027 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CENPFP49454 3210 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 RAD51CO43502 376 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 RECQL4O94761 1208 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GLI1P08151 1106 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MYBL2P10244 700 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ELNP15502 786 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SP3Q02447 781 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 IFT20Q8IY31 132 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 IFT81Q8WYA0 676 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SNX27Q96L92 541 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SCINQ9Y6U3 715 aa15.53■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MMP8P22894 467 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 RAD23BP54727 409 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 MAMLD1Q13495 774 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ERICH1Q86X53 443 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 BEST2Q8NFU1 509 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CAPNS2Q96L46 248 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PARVAQ9NVD7 372 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.52■□□□□ 0.08
NICN1-201ENST00000273598 ESYT3A0FGR9 886 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GJB6O95452 261 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CALB1P05937 261 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PEX5P50542 639 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RWDD2BP57060 319 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CASP8Q14790 479 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms