RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE4BO95155 1302 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 NRCAMQ92823 1304 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 KRBA1A5PL33 1030 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NNZ2 444 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PDXKO00764 312 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA2O43364 376 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MGEA5O60502 916 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CLSTN1O94985 981 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 EOMESO95936 686 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC172P0C7W6 258 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 RPA1P27694 616 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SREBF1P36956 1147 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MTHFRP42898 656 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM9Q13443 819 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TDGQ13569 410 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ASIC2Q16515 512 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL7BQ6UX53 244 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TMC7Q7Z402 723 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF4BQ92750 862 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 HAS1Q92839 578 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCB6Q9NP58 842 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX12Q9UMY4 172 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 L1RE1Q9UN81 338 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.59□□□□□ -1.19
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP8B3O60423 1300 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC53A6NM62 1247 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SIAH2O43255 324 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 IVLP07476 585 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ADRB1P08588 477 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP3A4P08684 503 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TGFB3P10600 412 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EPCAMP16422 314 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CIITAP33076 1130 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CASP8Q14790 479 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC15Q8TF66 581 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CWH43Q9H720 699 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK12Q9HB15 430 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GINS2Q9Y248 185 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 M0QZ92 97 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3CDO00329 1044 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CES2O00748 559 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 OPA1O60313 960 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRN2O75325 713 aa7.57□□□□□ -1.2
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