RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 SH3GL3Q99963 347 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NCOA4Q13772 614 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 BBS2Q9BXC9 721 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PCMTD2Q9NV79 361 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CAND2O75155 1236 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 KRT75O95678 551 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CDC27P30260 824 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SV2CQ496J9 727 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 WNK4Q96J92 1243 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SLC38A7Q9NVC3 462 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 FAM187AA6NFU0 413 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 STXBP3O00186 592 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 P4HA2O15460 535 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ERVK-10P10266 1014 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NPEPPSP55786 919 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PARP9Q8IXQ6 854 aa17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NCAM1P13591 858 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 RGS2P41220 211 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PRIM2P49643 509 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 UGP2Q16851 508 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 GLB1LQ6UWU2 654 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 VN1R5Q7Z5H4 357 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NLRP1Q9C000 1473 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CD209Q9NNX6 404 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CDH18Q13634 790 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA18Q8TC71 538 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 AGPAT1Q99943 283 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 RANBP1P43487 201 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 POU4F1Q01851 419 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 FRMD5Q7Z6J6 570 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PNKPQ96T60 521 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TRABDQ9H4I3 376 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 GGT7Q9UJ14 662 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TTLL13PA6NNM8 815 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SLC1A1P43005 524 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 RAB14P61106 215 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CNTN1Q12860 1018 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 HAUS6Q7Z4H7 955 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SOX13Q9UN79 622 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 F8W810 466 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB39O15060 712 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 HMGCS2P54868 508 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 MTFR1Q15390 333 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 AMACRQ9UHK6 382 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ESYT3A0FGR9 886 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ACADMP11310 421 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 DEFA1P59665 94 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 DEFA3P59666 94 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 STRNO43815 780 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SERPINB4P48594 390 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ATL2Q8NHH9 583 aa17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 FYNP06241 537 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CMTM5Q96DZ9 223 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 STX3Q13277 289 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SMTNL2Q2TAL5 461 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PODNQ7Z5L7 613 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TUFT1Q9NNX1 390 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 GSTM1P09488 218 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NFKBIZQ9BYH8 718 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 STAT4Q14765 748 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 NLRP14Q86W24 1093 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 APPL1Q9UKG1 709 aa17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LAMC1-201ENST00000258341 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms