RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 TCEAL8Q8IYN2 117 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 ELMOD1Q8N336 334 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 HPS3Q969F9 1004 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 CDH7Q9ULB5 785 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 OAZ2O95190 189 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 ID4P47928 161 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 ADCY1Q08828 1119 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 SENP8Q96LD8 212 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 SPATA32Q96LK8 384 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 MAFFQ9ULX9 164 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-201ENST00000219479 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 OR6C75A6NL08 312 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PIRO00625 290 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 EXTL3O43909 919 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 TYMPP19971 482 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 AFMP43652 599 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 TAF6P49848 677 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ERMP1Q7Z2K6 904 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 METTL23Q86XA0 190 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 R4GN57 208 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ANO9A1A5B4 782 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PTPN2P17706 415 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 BECN1Q14457 450 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 UNC13DQ70J99 1090 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 GPD1LQ8N335 351 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 FGF13Q92913 245 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ZNF560Q96MR9 790 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 DSEQ9UL01 958 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 COL4A3Q01955 1670 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 NOTCH4Q99466 2003 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SPTLC1O15269 473 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SEC24AO95486 1093 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 RHOP08100 348 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SV2CQ496J9 727 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 IQCEQ6IPM2 695 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ITFG1Q8TB96 612 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CORO1BQ9BR76 489 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CYB561D2O14569 222 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 OR4Q2P0C623 313 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PNPLA4P41247 253 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 TWF1Q12792 350 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 MTSS1LQ765P7 747 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ING5Q8WYH8 240 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 FGF14Q92915 247 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 FOXQ1Q9C009 403 aa23.48■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PATJQ8NI35 1801 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SLFN14P0C7P3 912 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CASP1P29466 404 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 MYBPC2Q14324 1141 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 PARM1Q6UWI2 310 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 UBE4BO95155 1302 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-201ENST00000219479 CEP250Q9BV73 2442 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms