RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 EDF1O60869 148 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 STBD1O95210 358 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SOX10P56693 466 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 KIRREL3Q8IZU9 778 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ERP27Q96DN0 273 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 VSIG1Q86XK7 387 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ALLCQ8N6M5 410 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP170P1Q96L14 293 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 USTQ9Y2C2 406 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ALOX15BO15296 676 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 DCTN3O75935 186 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 CUL2Q13617 745 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 MORF4L2Q15014 288 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 DLGAP5Q15398 846 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 CPXCR1Q8N123 301 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SMC6Q96SB8 1091 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PARVAQ9NVD7 372 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ASNSP08243 561 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PASD1Q8IV76 773 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SPOCK2Q92563 424 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF862O60290 1169 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 TJP3O95049 919 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 VNN1O95497 513 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 GNA15P30679 374 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH3A1P30838 453 aa23.4■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3CAP42336 1068 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 MCL1Q07820 350 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 BICD1Q96G01 975 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PXMP2Q9NR77 195 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 TYROBPO43914 113 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ARSEP51690 589 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC38Q5VT99 294 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 C10orf82Q8WW14 230 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FNBP1Q96RU3 617 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT10P13645 584 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT15P19012 456 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCD1P33897 745 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PSEN1P49768 467 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 WNT7BP56706 349 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RMDN3Q96TC7 470 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 H0YCG3 227 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 NDC80O14777 642 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 DGAT1O75907 488 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TNNI1P19237 187 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PAX7P23759 505 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN7P35236 360 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K10Q02779 954 aa23.38■■□□□ 1.33
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