RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224820.1

Zkscan3-208, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

BASIC

Gene Zkscan3, Length 5,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Smok2aQ9QYZ6 504 aa16.65■□□□□ 0.26
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm8271L7N2E2 218 aa16.64■□□□□ 0.25
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Arhgef26D3YYY8 869 aa16.63■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tlx1P43345 332 aa16.63■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Anxa5P48036 319 aa16.63■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Sparcl1P70663 650 aa16.63■□□□□ 0.25
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pcgf5Q3UK78 256 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 SpdyaQ5IBH7 310 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gucy2gQ6TL19 1100 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 TdrkhQ80VL1 560 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slit1Q80TR4 1531 aa16.62■□□□□ 0.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa16.62■□□□□ 0.25
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc12a1P55014 1095 aa16.62■□□□□ 0.25
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