RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	NRM1	P53718	249 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	HHT1	P61830	136 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	IRC15	Q02733	499 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	TSA2	Q04120	196 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YET1	P35723	206 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	SCO2	P38072	301 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	AVT5	P38176	459 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	MTC6	P38849	526 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	AYR1	P40471	297 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	MNN5	P46982	586 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	ILM1	P47155	203 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	FRE8	Q12209	686 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	SIR2	P06700	562 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	MSI1	P13712	422 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	PHO13	P19881	312 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	PMU1	P36069	295 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	ARN2	P38724	620 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	APQ12	P40532	138 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	PIR3	Q03180	325 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	FAR10	Q06001	478 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMD8	YML038C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	CDC7	P06243	507 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	HYM1	P32464	399 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	COS8	P38723	381 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	PET8	P38921	284 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	COX14	P39103	70 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	PEX17	P40155	199 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	XBP1	P40489	647 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	SER2	P42941	309 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	PAC10	P48363	199 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	SDT1	P53078	280 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	MDM34	P53083	459 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YGL101W	P53144	215 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YGR018C	P53211	109 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	HHO1	P53551	258 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	CRZ1	P53968	678 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	PET191	Q02772	108 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	AGA1	P32323	725 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YKL102C	P34249	101 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	NAT2	P37293	288 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	CHL4	P38907	458 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YER189W	P40104	122 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	OST2	P46964	130 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	GWT1	P47026	490 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	ORM1	P53224	222 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	SLM2	P53955	656 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	ATG39	Q06159	398 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	DGA1	Q08650	418 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	TOR1	P35169	2470 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	RPN13	O13563	156 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	HEM4	P06174	275 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	ERD2	P18414	219 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	STP22	P25604	385 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	PTM1	P32857	523 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	SOL2	P37262	315 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	POP8	P38208	133 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YBR220C	P38318	560 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	HEM14	P40012	539 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	MRH4	P53166	561 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YNL234W	P53857	426 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	YNL046W	P53956	172 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	GOT1	Q03554	138 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YMD8	YML038C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71

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